咳嗽时小腹两侧疼痛，可能与腹壁痉挛、胃肠型感冒、肌肉劳损等因素有关。具体如下：
一、腹壁痉挛：咳嗽是常见症状，若长期咳嗽可能使机体免疫力下降。此时若腹部保暖不佳，易引发腹部痉挛，从而导致咳嗽时小腹两侧疼痛。对于因受凉引起的腹壁痉挛，要做好保暖工作，避免穿过于短小的衣物。
1.症状表现：主要为咳嗽伴小腹两侧疼痛。
2.处理措施：注重腹部保暖。
二、胃肠型感冒：这是一种自限性疾病，多由病毒感染导致胃肠道功能紊乱，除咳嗽时小腹两侧疼痛外，通常还伴有恶心、呕吐、腹泻、发热等表现。
1.症状表现：有咳嗽、小腹两侧疼痛、恶心、呕吐、腹泻、发热等多种症状。
2.处理措施：临床症状较轻时通常无需特殊处理，但要做好生活护理；症状严重时，可在医生指导下使用利巴韦林、蒙脱石散等药物治疗。
三、肌肉劳损：若突然剧烈运动或剧烈运动时间过长，可能导致肌肉劳损，进而引起咳嗽时小腹两侧疼痛。
1.症状表现：主要为咳嗽伴小腹两侧疼痛。
2.处理措施：疼痛严重者可给予布洛芬、阿司匹林等药物止痛，还可配合冷敷缓解疼痛。
如果咳嗽症状严重，还可在医生指导下使用甘草片、止咳糖浆等药物治疗。
总结：当出现咳嗽时小腹两侧疼痛的情况，可能是腹壁痉挛、胃肠型感冒、肌肉劳损等原因所致，应根据具体情况进行相应处理，若咳嗽严重也需对症治疗。