肛瘘主要症状有肛周反复流脓，大约有80%的肛瘘患者会出现这种情况，脓液量时多时少，且可能伴有异味。另外，肛周会有肿痛感，当瘘管通畅时，肿痛感可能较轻，但当引流不畅时，肿痛会明显加重，甚至影响行走。还有肛周瘙痒，由于脓液不断刺激肛周皮肤，约50%的肛瘘患者会出现肛周皮肤瘙痒，皮肤可能会变得潮湿、潮红。
流脓情况
间歇性流脓：肛瘘患者的流脓通常是间歇性的，在瘘管闭合时，脓液积聚，会出现流脓现象；当瘘管重新开放引流后，流脓会减少或暂时停止。比如有些患者可能隔几天就会出现一次流脓情况。脓液性状：脓液一般比较稀薄，呈黄色、白色，有时可能会带有血性分泌物。如果继发感染，脓液会变得浓稠，颜色也会变黄、绿等。
肿痛表现
急性发作时肿痛明显：当肛瘘发生急性感染时，肿痛会突然加重，局部会出现红肿热痛，疼痛程度较为剧烈，可能会影响患者的坐立和行走。一般在感染后的1 - 2天内肿痛感最为明显。慢性期肿痛较轻：在肛瘘的慢性期，肿痛相对较轻，可能仅表现为局部的隐痛或坠胀感，患者可能能正常生活，但在身体抵抗力下降时，又会出现急性发作的肿痛情况。
肛周瘙痒细节
瘙痒原因：主要是因为肛瘘流出的脓液不断刺激肛周皮肤，导致皮肤受到刺激而产生瘙痒感。这种瘙痒感可能比较顽固，患者会不自觉地去搔抓肛周皮肤。皮肤变化：由于长期搔抓，肛周皮肤会出现色素沉着、粗糙、增厚等改变，严重的还可能引起皮肤破损、糜烂等情况。例如有些患者搔抓后会出现小的破损，容易引发继发感染，加重病情。