腔隙性脑梗死主要是脑部深穿支动脉闭塞引起的微小梗死灶，常见原因有以下这些。首先是高血压，据统计，约有一半的腔隙性脑梗死患者与高血压有关。长期高血压会使脑内小动脉发生玻璃样变、动脉硬化等，导致血管狭窄甚至闭塞，进而引发腔隙性脑梗死。
高血压因素
长期血压控制不佳： 血压长期高于正常范围（收缩压≥140mmHg和/或舒张压≥90mmHg），会持续损伤脑血管，增加血管壁的通透性和脆性，使得血液中的有形成分更容易沉积在血管壁，逐渐形成血栓，堵塞小血管。血压波动过大： 血压忽高忽低比持续高血压对血管的损害可能更严重。比如原本血压130/80mmHg，突然飙升到180/110mmHg，又很快回落到正常，这种大幅度的波动会使血管反复处于紧张和舒张状态，容易造成血管内皮损伤，为腔隙性脑梗死的发生埋下隐患。
动脉硬化因素
动脉粥样硬化： 随着年龄增长，人体血管会逐渐出现动脉硬化，这是一种自然的生理过程，但如果存在高脂血症、糖尿病等情况，会加速动脉硬化的进程。血液中的脂质成分如胆固醇等会沉积在动脉血管壁内，形成粥样斑块，使血管腔变窄，影响脑部血液供应，当供应脑部深穿支的血管被粥样斑块堵塞时，就可能引发腔隙性脑梗死。小动脉硬化： 除了大的动脉粥样硬化外，脑部的小动脉也会发生硬化。小动脉硬化会使血管壁增厚、管腔狭窄，同样会影响局部脑组织的血液供应，导致局部脑组织缺血、缺氧，最终形成腔隙性梗死灶。
糖尿病因素
高血糖损伤血管： 糖尿病患者长期高血糖状态会损伤血管内皮细胞，使血管内皮功能紊乱。高血糖还会促进血液中血小板的聚集，增加血液黏稠度，容易形成血栓。同时，高血糖会影响血管的正常代谢，导致血管壁的弹性降低，容易发生狭窄和闭塞，进而引发腔隙性脑梗死。据研究，糖尿病患者发生腔隙性脑梗死的风险比非糖尿病患者高2 - 3倍。长期血糖控制不良： 即使血糖只是轻度升高且长期未得到有效控制，也会逐渐对血管造成损害。例如，糖化血红蛋白长期高于7%，就会明显增加腔隙性脑梗死的发病几率。