念珠菌感染的治疗药物有多种，一般来说，常用的抗念珠菌药物有氟康唑等。氟康唑是一种广谱抗真菌药物，对念珠菌感染有较好的疗效。
外用抗真菌药物
局部外用制剂： 比如克霉唑制剂，常用于治疗皮肤念珠菌感染，可直接涂抹在感染部位，抑制念珠菌的生长繁殖。硝酸咪康唑乳膏： 也可用于皮肤念珠菌感染的局部治疗，能通过干扰念珠菌的细胞膜合成来发挥作用。
口服抗真菌药物
氟康唑： 是较为常用的口服抗真菌药，对于一些浅表及深部的念珠菌感染都有一定疗效。它能抑制念珠菌细胞色素P450依赖酶，从而阻断麦角固醇的生物合成，达到抗真菌效果。伊曲康唑： 也是口服抗真菌药物，对念珠菌感染有作用，其作用机制是抑制真菌细胞膜麦角固醇的合成，影响真菌的代谢过程。
特殊人群用药注意
孕妇： 孕妇发生念珠菌感染时用药需谨慎，一般不首选口服抗真菌药物，可能会优先考虑局部外用药物，因为要避免口服药物对胎儿产生潜在影响，需在医生评估后选择合适的治疗方案。儿童： 儿童患念珠菌感染时，用药要特别注意，通常会根据儿童的年龄、感染部位和严重程度等来选择药物，比如对于儿童皮肤念珠菌感染，可能会优先选择刺激性较小的外用抗真菌药物，且要严格遵循医生的用药建议，因为儿童的肝肾功能等发育尚未完全成熟，药物代谢等与成人有差异。