阴茎短小通常采用手术方式处理。
一、正常情况：男性勃起长度大于九厘米属于正常，阴茎只要不是过小，一般不影响性生活。但若阴茎短小已影响到性生活，应及时到医院检查治疗。
1.手术治疗：如果患者有强烈改善阴茎短小的需求，可选择手术。可做阴茎延长增粗手术，此手术需在全麻状态下进行，手术创伤较大，应慎重选择。不过，即便通过阴茎延长手术放入阴茎假体延长了阴茎，术后阴茎外观上稍长，但勃起状态下与原来长度相差不大。
2.特殊情况：
(1)儿童时期：若儿童阴茎短小，通常需减肥，待耻骨联合处脂肪消失，阴茎可恢复正常。
(2)青少年时期：青少年阴茎短小主要因手淫或包皮过长。必须尽快彻底戒除手淫并割除包皮，以促进阴茎正常发育。
总之，对于阴茎短小的情况要根据具体状况采取合适的处理方式。