眼睛里滤泡多通常是由结膜炎导致的，即滤泡性结膜炎。而滤泡长期不消失是由于结膜炎未被完全治好，致使病情反复迁延。可通过如下方式予以治疗：
一、中医方剂治疗
三花汤可以发挥出辛凉宣肺、祛风清热以及化瘀通络的作用，尽早使用能缓解眼部疼痛、红肿等情况。
二、滴眼液治疗
诺氟沙星滴眼液属于喹诺酮类抗菌药物，在滤泡性结膜炎的治疗上效果显著，需将其滴入眼睑内。
三、饮食调理
对于结膜炎滤泡严重的患者，在发病期间要合理安排日常饮食，不能吃过于生冷或辛辣的食物，可适当多进食一些高蛋白类食物，比如鸡蛋、豆制品、瘦肉等都是较好的选择，还应该多摄入一些新鲜的水果或蔬菜。
总结：眼睛滤泡多与滤泡性结膜炎有关，可通过中医方剂、滴眼液及饮食调理等方法进行治疗，以改善症状，促进康复。