疣状痣的治疗方法有多种，一般可以通过手术治疗、激光治疗等方式。手术治疗适用于较大的疣状痣，通常可以一次性切除，但可能会留下疤痕。激光治疗则是利用激光的能量破坏疣体组织，一般需要多次治疗，每次治疗间隔几周。
手术治疗方面
直接切除：对于面积不是特别大的疣状痣，可以考虑直接切除缝合。不过要注意，儿童患者在进行手术时需谨慎评估，因为儿童皮肤愈合能力虽强，但手术创伤可能对其心理和身体发育有一定影响。植皮或皮瓣转移：如果疣状痣面积较大，直接切除后无法直接缝合，可能需要植皮或者皮瓣转移。比如面积超过一定范围（临床一般认为超过10cm²可能就需要考虑植皮等方法），植皮需要从身体其他部位取皮，皮瓣转移则是利用周围正常皮肤组织转移来覆盖创面。
激光治疗情况
二氧化碳激光：这是常用的激光治疗方式之一。利用二氧化碳激光的高能量，精准地烧灼疣体组织。一般来说，每次激光治疗间隔3~4周，儿童患者进行激光治疗时，要调整好激光能量，避免能量过高对儿童皮肤造成过度损伤。治疗后局部会有结痂，要让痂皮自然脱落，防止感染。脉冲染料激光：对于疣状痣伴有血管增生情况的可能会用到。它主要是针对血管病变，通过选择性光热作用破坏异常血管。但对于单纯的疣状痣组织破坏作用相对二氧化碳激光弱一些，可能需要结合其他方式。
冷冻治疗手段
液氮冷冻：利用液氮的低温使疣体组织坏死脱落。冷冻治疗适用于较小的疣状痣。治疗后局部会出现水疱、结痂等反应，一般1~2周结痂脱落。儿童皮肤较薄，冷冻时要控制好冷冻的时间和范围，避免冻伤周围正常皮肤。冷冻可能需要多次治疗，间隔时间一般为2~3周。