男性性功能主要的检查包括：
一、男性外生殖器检查：这主要是对男性的外生殖器进行全面细致的查看。具体来说，要观察男性阴毛和阴茎的发育情况是否正常，比如有没有出现尿道下裂或尿道上裂等畸形情况，包皮状态是怎样的，是否存在过长或包茎等问题；还要查看尿道外口是否狭窄，双侧阴囊是否对称，双侧睾丸的大小、形态以及质地等是否处于正常状态。
二、激素六项检查：通过此项检查可以了解男性睾酮水平是否在正常范围内，泌乳素水平有无升高。
三、男性勃起功能检查：其中的夜间勃起功能试验能够帮助发现男性是否存在器质性勃起功能障碍。
四、球海绵体反射检查：该检查可用于判断是否存在神经源性勃起功能障碍。
五、阴茎勃起电位检查：能检测出阴茎神经是否存在过度敏感等现象，以及阴茎背神经和阴茎系带处是否有感觉障碍等情况。
总之，这些检查对于全面评估男性性功能状况具有重要意义，能够帮助准确诊断相关问题并为后续治疗提供依据。