避孕套不能百分百避孕的原因主要有以下几点：
1.不正确使用：避孕套的使用方法不正确会影响避孕效果。如果在使用前没有检查避孕套是否有破损或过期，或者在使用过程中没有全程使用，或者在射精后没有及时捏住避孕套根部拔出，都可能导致避孕失败。
2.尺寸不合适：避孕套的尺寸不合适也会影响避孕效果。如果避孕套过大，可能会在性交过程中脱落或破裂；如果避孕套过小，可能会影响阴茎的血液循环，导致避孕失败或引起不适。
3.过敏反应：有些人对避孕套的材质或润滑剂过敏，可能会引起过敏反应，影响避孕效果。
4.其他因素：使用油性润滑剂、性交过程中避孕套受到损伤、患有性传播疾病等也可能导致避孕失败。
需要注意的是，以上因素并不是一定会导致避孕失败，只是增加了避孕失败的风险。为了提高避孕效果，建议正确使用避孕套，并注意以下几点：
1.在性交前检查避孕套的有效期和完整性。
2.按照说明书正确使用避孕套，全程使用。
3.选择合适尺寸的避孕套。
4.避免使用油性润滑剂。
5.如果对避孕套的材质或润滑剂过敏，可以选择使用其他避孕方法。
6.如果避孕套在使用过程中破裂或脱落，应立即停止性交，采取紧急避孕措施。