非淋菌性尿道炎是由沙眼衣原体、解脲支原体等病原体引起的性传播疾病，男性患者早期可能出现尿道刺痒、灼痛，还可能伴有轻重不同的尿频、尿急、尿痛等症状，部分患者尿道口会有少量稀薄的浆液性分泌物，晨起时可能发现尿道口有痂膜封口现象。女性患者症状相对男性更不典型，可能有阴道分泌物增多、白带异常等表现，少数人会有尿频、尿痛等症状。
常见症状表现
男性典型症状： 尿道内会有瘙痒感，有时还会出现灼烧样疼痛，排尿时疼痛可能会加重。部分患者尿道口会有轻度红肿，分泌物稀薄，呈浆液性或脓性，量比较少，有些患者晨起时会发现尿道口有结痂现象，形成“糊口”样改变。女性常见表现： 女性患者症状往往不如男性明显，可能仅有阴道分泌物增多的情况，白带会变得比较浑浊，颜色发黄。少数女性会出现尿频、尿痛的症状，但相对男性来说程度较轻。
症状出现的时间特点
潜伏期情况： 非淋菌性尿道炎的潜伏期一般为1 - 3周。也就是说，在感染病原体后，通常1周到3周左右会逐渐出现上述症状。如果有高危性行为后，在1 - 3周内出现尿道或阴道的不适症状，就要高度怀疑患有非淋菌性尿道炎。
与其他疾病的症状区别
与淋病的症状区别： 淋病的分泌物往往比较多，呈脓性，量较多，而非淋菌性尿道炎的分泌物相对较少，多为稀薄的浆液性或脓性。另外，淋病引起的尿痛通常更为剧烈，非淋菌性尿道炎的尿痛相对较轻。与膀胱炎的症状区别： 膀胱炎主要表现为明显的尿频、尿急、尿痛，严重时会有血尿，而非淋菌性尿道炎除了有尿道不适症状外，尿频、尿急等症状相对膀胱炎来说没那么典型，且非淋菌性尿道炎多有性传播相关的诱因，而膀胱炎不一定有。