治疗胆结石并没有绝对“最好”的药，常用的溶石、排石等药物有熊去氧胆酸等，但一般对于胆固醇结石有一定效果，不过药物治疗通常适用于结石较小、症状较轻且胆囊功能较好的情况，且需在医生指导下使用。
溶石类药物情况
熊去氧胆酸： 它可以抑制胆固醇的合成，增加胆汁中胆固醇的溶解度，从而使胆固醇结石逐渐溶解。一般需要连续服用数月甚至更长时间，比如可能需要服用3 - 6个月左右来观察效果，但并非所有人都能通过它完全溶解结石。不过它有一定的禁忌，像胆道梗阻的患者就不能使用。
缓解症状类药物
消炎利胆类： 比如消炎利胆片，它能起到清热、祛湿、利胆的作用，可缓解胆结石引起的右上腹隐痛、胀痛等症状。不过它也有注意事项，脾胃虚寒者慎用，在服用期间要注意饮食清淡，避免吃辛辣、油腻的食物。解痉止痛类： 当胆结石引发胆绞痛时，常用山莨菪碱等药物来解痉止痛。山莨菪碱能缓解胆道平滑肌痉挛，但青光眼患者禁用该类药物。
药物治疗的局限性
适用人群有限： 药物治疗并非对所有胆结石患者都有效，对于结石较大、数量较多或者胆囊已经失去功能的患者，药物治疗往往效果不佳，这时候可能需要手术治疗。比如结石直径大于2 - 3厘米的患者，单纯靠药物很难解决问题。存在复发风险： 即使药物暂时溶解了结石，停药后结石也有复发的可能，因为体内形成结石的因素并没有完全消除，像胆汁成分异常等情况可能依然存在。