子宫内膜异位症的治疗需根据患者年龄、症状、病变部位及范围等综合考虑，常见的治疗方法包括药物治疗、手术治疗等。一般来说，治疗方案的选择要个体化。
药物治疗方面
非甾体抗炎药：像布洛芬等，可缓解轻至中度的疼痛症状，能抑制体内前列腺素的合成，从而减轻疼痛，但只能暂时缓解症状，不能从根本上治疗子宫内膜异位症。避孕药：复方口服避孕药是常用的，它通过抑制排卵，改变宫颈黏液性状等，使子宫内膜萎缩，减少异位内膜的生长，一般连续服用3 - 6个月为一个疗程。
手术治疗情况
保守性手术：适用于有生育要求的年轻患者。比如腹腔镜下盆腔异位病灶切除术，可保留子宫、一侧或双侧卵巢，尽量保留正常的卵巢组织，但术后有复发的可能，据统计复发率在50%左右。根治性手术：适用于年龄较大、无生育要求且病情严重的患者。行全子宫及双侧附件切除术，术后不需要再用药物治疗，但会导致患者提前进入更年期。
聚焦妊娠相关治疗
期待治疗：对于症状较轻、有生育要求的患者，可采用期待治疗，定期随访，一般每6 - 12个月进行一次妇科检查及超声等检查。如果在期待治疗期间怀孕，异位的内膜可能会萎缩，病情有一定程度的缓解。但如果超过1年仍未怀孕，可能需要考虑其他治疗方法。