怀孕40天在流产方式上药物流产或人工流产都可选择，具体情况如下：
一、药物流产：
1.是指通过使用药物来终止早期妊娠，一般适合怀孕49天以内且超声下未见胎芽、胎心的女性。
2.常用流产药物为米非司酮片和米索前列醇片等，且必须在医生监督下使用。
3.可能存在阴道出血时间长、感染机会增加等情况，不建议有进一步生育要求的患者采用，也不用于40岁以上患者。
二、人工流产：
1.是指妊娠3个月内通过人工使用工具终止妊娠，怀孕40天进行人工流产也较为合适。
2.常用人工流产方式包括负压吸引术、钳刮术等。
3.该流产术可能导致子宫内膜受损伤，有继发不孕的风险，对于没有生育过的患者需注意月经恢复情况，以便及时发现问题并用药恢复子宫内膜功能，从而减少不孕的风险。
总之，怀孕40天可根据自身具体情况来选择合适的流产方式，但无论选择哪种，都要谨慎考虑并在专业医生的指导下进行，同时要注意流产后的护理和恢复。