上热下寒的根本原因主要与人体的脏腑功能失调等有关。从中医角度来看，常见原因包括以下几方面。首先是先天禀赋因素，部分人先天体质就存在阴阳失衡的倾向，比如有些婴儿出生后就可能存在潜在的阴阳失调基础，为日后出现上热下寒埋下隐患。
脏腑功能失调导致
脾胃功能紊乱：脾胃是人体气机升降的枢纽。如果长期饮食不节，比如经常吃过多辛辣油腻食物，就会损伤脾胃。脾胃受损后，运化功能失常，清气不能上升，浊气不能下降，就容易出现上热下寒。例如，长期嗜食辣椒、油炸食品的人，可能会出现上焦有热，表现为口干、口疮等，而下焦有寒，出现腹痛、腹泻等症状。肾阳不足：肾为先天之本，内寓元阴元阳。当肾阳不足时，不能温煦下焦，就会导致下焦虚寒。同时，肾阳不足不能上济于心，就会引起上焦有热象。比如一些中老年人，随着年龄增长，肾阳渐衰，容易出现上热下寒，表现为头目眩晕、面红如妆但下肢厥冷等。
生活方式因素影响
作息不规律：长期熬夜会耗伤人体的阴液，导致上焦虚火亢盛，出现心烦、失眠等上热表现。而熬夜又会损伤阳气，影响肾阳的温煦功能，导致下焦虚寒，出现腰膝冷痛、大便溏泄等下寒表现。比如一些经常熬夜加班的上班族，就容易出现上热下寒的情况。过度劳累：过度劳累会耗伤气血，损伤正气。气血不足则脏腑功能失调，阳气不能很好地温养下焦，而阴液耗伤则上焦容易有热。例如长期从事重体力劳动的人，可能会出现上有虚热，如咽干、烦躁，下有虚寒，如腰膝酸软、怕冷等。
疾病影响造成
慢性疾病作祟：一些慢性疾病也会导致上热下寒。比如患有慢性肾病的患者，由于肾脏功能受损，肾阳亏虚，不能温煦机体，同时阴液耗伤，会出现上热下寒。表现为面色潮红但手脚冰凉、口干但喜欢喝热水等。再如患有慢性肝病的人，肝脏疏泄功能失常，也可能影响气机的升降，导致上热下寒，出现胁肋胀痛、口干口苦（上热），同时伴有腹胀、便溏（下寒）等表现。