头孢噻呋钠和头孢喹肟哪种药物更好不能一概而论，因其应用对象存在差异。
一、头孢噻呋钠：
1.这是第三代头孢菌素，通过抑制细菌细胞壁合成发挥杀菌作用。
(1)抗菌谱较广，对革兰阳性菌有杀灭效果，更重要的是对多种革兰阴性菌有很强杀菌效果。
(2)在临床上常用于敏感细菌导致的多部位感染，如呼吸道的支气管炎、肺炎；泌尿道的尿道炎、肾盂肾炎、膀胱炎；骨头和关节的骨髓炎、关节炎；皮肤和软组织感染；腹腔、胆道、消化道感染；生殖系统感染等，注射用头孢噻肟钠对此均有疗效。
二、头孢喹肟：
1.是目前唯一动物专用的第四代头孢类抗生素，具有抗菌谱广、抗菌活性强等特点。
(1)适用于非肠道用药。
(2)临床上主要用于敏感菌引起的猪、牛呼吸系统感染，以及奶牛乳房炎、母猪无乳综合症的临床治疗，其副作用相对较小。
总之，头孢噻呋钠和头孢喹肟各有其特点和适用范围，应根据具体情况选择使用。