三岁宝宝晚上咳嗽白天不咳的原因包括非疾病因素和疾病因素。非疾病因素有环境刺激、睡眠习惯等；疾病因素包含呼吸道炎症或者过敏、胃食管反流、鼻后滴漏综合征等。
一、非疾病因素
1.环境刺激：夜晚气温通常比白天低，温差较大时，宝宝吸入冷空气会刺激气道，从而引发晚上咳嗽白天不咳的情况。
2.睡眠习惯：宝宝睡觉时若张口呼吸，容易导致咽部干燥，进而引起刺激性咳嗽。
二、疾病因素
1.呼吸道炎症或者过敏：
(1)过敏性咳嗽、过敏性哮喘、支气管炎、鼻窦炎等疾病会引起咳嗽。在晚上，迷走神经兴奋、支气管痉挛以及呼吸道分泌物增多，都会使咳嗽加重。建议先检查过敏原，必要时做肺功能检查以明确诊断，同时要在医生指导下进行对症和对因治疗。
(2)鼻后滴漏综合征：这是由于鼻咽部炎症或者息肉等疾病导致的。宝宝夜间睡觉时鼻涕倒流会刺激咽部产生咳嗽，还可能伴有鼻腔分泌物增加。对于这类宝宝，天气转凉时要及时增添衣物以防着凉，晚上睡觉时要保持正确的睡眠姿势，保持室内空气清新、湿润。
2.胃食管反流：当宝宝晚上进食过饱或睡前进食后，因夜间体位变化会导致胃内食物反流，刺激上呼吸道而引发咳嗽。对此类宝宝要控制晚餐进食量，尽量避免晚餐过饱及睡前进食。
总之，对于有疾病因素的宝宝，家长在治疗恢复期间需给宝宝提供清淡饮食，避免其进食过于辛辣的食物、海鲜等。要密切关注宝宝的状况，以便及时采取相应的措施。