大部分在受精卵着床后半个月左右，通过B超检查可看到孕囊，且能在孕囊内看到卵黄囊，不过具体时间因人而异，存在一定差别。若孕妇怀孕40至50天，B超仍看不见孕囊，可能原因如下：
一、怀孕天数较短。计算怀孕天数是针对月经规律的女性，其月经周期为28至30天，每次持续5至7天。而对于月经不规律的女性，着床时间即B超查出孕囊的时间会与月经规律女性不同。
1.月经不规律女性可能出现这种情况。
(1)其体内激素水平不稳定，会影响受孕时间和孕囊出现时间。
(2)可能导致排卵时间不固定，进而影响孕囊的显示时间。
二、孕妇可能出现流产或生化妊娠，多数在40至50天看不到孕囊，且孕妇会出现阴道出血、腹痛等症状。此时不仅要依靠B超检查确定怀孕孕囊发育情况，还需结合HCG、孕酮判断。若已流产或生化妊娠，孕妇抽血化验HCG会有下降趋势。
三、孕妇经过一系列检查后，子宫腔内看不到孕囊，可能是孕囊着床在附件区或其他地方。若明确诊断为宫外孕，应及时住院治疗，以防孕囊不断生长引发大出血，危及孕妇生命安全。
总之，孕妇怀孕后B超检查孕囊的情况较为复杂，需综合多种因素进行分析和判断。