HPV感染后，很多人初期没有明显症状，部分人会出现生殖器部位的异常表现。比如，女性感染高危型HPV，持续感染可能引发宫颈病变，早期可能没有症状，随着病情发展，可能出现阴道不规则出血，比如性生活后或绝经后阴道出血；还可能有阴道分泌物增多，白带变得黏稠、有异味等情况。而低危型HPV感染可能引起生殖器疣，在外生殖器部位出现菜花样、鸡冠样或乳头状的赘生物，大小不一，可能单个存在，也可能多个聚集。
女性感染HPV的症状表现
宫颈病变相关症状： 早期宫颈病变通常无症状，随着病变进展，可能出现接触性出血，就是在性生活或者妇科检查后出现阴道少量流血。还可能有阴道异常排液，液体可为白色或血性，稀薄如水样或米泔状，有腥臭味。生殖器疣相关症状： 在外阴、阴道、宫颈等部位出现淡红色小丘疹，逐渐增大增多，融合成乳头状、菜花状或鸡冠状赘生物，一般没有明显疼痛，但可能有瘙痒感。
男性感染HPV的症状表现
生殖器疣症状： 男性感染低危型HPV时，可能在阴茎、阴囊、肛周等部位出现疣状病变，表现为单个或多个丘疹，逐渐增大成乳头状、菜花状等，一般无明显自觉症状，少数人可能有瘙痒、异物感等。潜在高危感染症状： 男性感染高危型HPV，一般早期也没有明显症状，但持续高危型HPV感染可能增加阴茎癌等疾病风险，不过这种情况相对少见，一旦发生可能有阴茎局部肿块、溃疡、出血等表现，但这往往是疾病进展到较严重阶段才会出现。
HPV感染无症状的情况
很多人感染HPV后是没有明显症状的，这就是所谓的亚临床感染或潜伏感染状态。人体免疫系统有一定清除HPV的能力，约80%的人感染HPV后，在8-10个月内会被自身免疫系统清除，所以很多人虽然感染了HPV，但没有任何不适症状，自己都不知道感染过。不过，对于持续感染高危型HPV的人群，需要密切监测，因为持续感染可能引发病变。