淋病奈瑟氏菌感染主要通过抗生素治疗，常用的有头孢曲松等药物，一般规范治疗后可取得较好效果。
治疗药物选择
头孢曲松： 是治疗淋病奈瑟氏菌感染的常用药物之一，它通过抑制细菌细胞壁的合成发挥杀菌作用。一般采用单次肌肉注射的方式给药。大观霉素： 对于一些对头孢曲松耐药的情况可以选用大观霉素，同样也是肌肉注射给药。
治疗期间注意事项
禁止性生活： 在治疗淋病奈瑟氏菌感染期间，一定要避免性生活，因为淋病具有传染性，性生活可能会将病菌传染给他人，一般需要治疗结束后经过复查确认治愈后才能恢复正常性生活。注意个人卫生： 要保持外阴清洁干燥，每天用温水清洗外阴，勤换内裤，内裤要单独清洗，避免交叉感染。
性伴侣的处理
性伴侣同时检查治疗： 淋病奈瑟氏菌感染患者的性伴侣也需要同时进行检查，如果发现感染也需要一起治疗，否则即使患者自身治愈了，与性伴侣再次接触还会被传染，导致病情反复。告知性伴侣病情： 患者要如实告知性伴侣自己的病情，让性伴侣重视并及时接受检查和治疗。
治疗后的复查
复查时间： 在完成治疗后，一般需要在治疗结束后1 - 2周进行复查，通过涂片检查、核酸检测等方法来确认淋病奈瑟氏菌是否已经被彻底清除。如果复查结果为阴性，才意味着基本治愈；如果复查仍为阳性，则需要考虑调整治疗方案。