做胃镜肠镜的痛苦程度与所选择的检查方式紧密相关。普通胃肠镜检查会比较痛苦，而无痛胃肠镜检查通常不会有痛苦感。
胃肠镜检查主要包含普通胃肠镜以及无痛胃肠镜这两种方式。
一、若患者进行的是普通胃肠镜检查，仅是在口咽部或肛门处使用局部麻醉药物后，患者于意识清醒状态下进行胃肠镜检查。因为在胃肠镜进镜过程中，会产生显著的刺激，进而引发呕吐或肛门不适等感觉，所以整个检查过程会较为痛苦。
1.（1）口咽部或肛门局部麻醉；（2）患者意识清醒；（3）进镜有明显刺激，导致呕吐或肛门不适；（4）检查痛苦。
二、要是患者选择的是无痛胃肠镜检查，那么是在检查前通过静脉输注全身麻醉药物，使患者处于短暂的意识丧失状态下进行胃肠镜检查。由于在检查过程中患者没有意识，所以一般不会感觉到痛苦。
1.（1）检查前静脉输注全麻药物；（2）患者意识短暂丧失；（3）检查无痛苦。
总之，在进行胃镜肠镜检查时，应根据自身情况和对痛苦的耐受程度来合理选择检查方式。