北京有众多可进行飞秒手术的优质医院。以下是比较推荐的三家：
一、中国医学科学院北京协和医院：
1.其眼科成立很早，设有眼底、青光眼、角膜和屈光、神经眼科、葡萄膜炎、眼视光和斜视弱视、眼整形和泪道、眼遗传、眼科流行病与防盲等专业组，还配备眼科实验室供临床和研究使用。
2.协和眼科在各专业领域有经验丰富的知名专家，可为全国各地的疑难眼病患者提供服务，是值得患者信赖的选择。
二、北京中医药大学第三附属医院：
1.眼科注重中西医结合治疗眼病，除开展常规现代手术外，对诸多眼科疑难杂症采用中西医结合治疗，能发挥各自优势以帮助患者。
2.还开设小儿近视和干眼专病门诊，采用中西医结合方法诊治青少年近视和干眼等常见病。
三、首都医科大学附属北京友谊医院：
1.眼科由多名经验丰富的专家组成，拥有国内领先技术及设备。
2.病房手术室条件为高标准层流设施，有先进手术显微镜等设备，可进行白内障、视网膜及玻璃体等眼底疾病、青光眼、角膜移植、斜视等各类手术治疗。
总之，在北京做飞秒手术的医院选择较多，患者在选择时除关注医院资质外，还需了解具体医生的擅长与经验。