根据问题需求，在月经结束后第三天进行同房，怀孕的概率较小，但仍有可能怀孕。以下是对该问题的具体分析：
1.女性的排卵日期一般在下次月经来潮前的14天左右。排卵日的前5天和后4天，连同排卵日在内共10天称为排卵期。在排卵期内同房，怀孕的概率较高。如果月经周期规律，月经结束后第三天通常处于安全期，怀孕的概率较小。
2.然而，需要注意的是，女性的排卵时间可能会受到情绪、环境、健康状况等因素的影响而发生变化。因此，安全期避孕法并不可靠，不能作为一种常规的避孕方法。
3.如果没有怀孕的计划，建议在同房时采取有效的避孕措施，如使用避孕套、口服避孕药等。此外，保持良好的生活习惯，如规律作息、均衡饮食、减少压力等，也有助于维持女性的生殖健康。
4.如果对怀孕的概率存在疑虑，或者出现月经推迟、恶心、呕吐等怀孕症状，建议及时进行验孕或咨询医生，以确定是否怀孕。
综上所述，在月经结束后第三天同房，怀孕的概率较小，但仍有可能怀孕。如果对怀孕问题有任何疑问或担忧，建议咨询医生或专业的医疗机构。