多脏器功能衰竭通常是由多种严重疾病或损伤引发的。比如严重感染时，像败血症，细菌产生的毒素等会损伤多个器官功能。据统计，在重症监护病房中，约有一定比例的患者会出现多脏器功能衰竭情况。
一、感染相关原因
严重细菌感染： 当人体遭受如肺炎克雷伯菌、大肠埃希菌等强致病性细菌引起的严重感染，细菌大量繁殖并释放毒素，会影响多个器官的正常功能。例如败血症，细菌侵入血液后，毒素随着血液循环攻击心脏、肝脏、肾脏等多个脏器，导致心功能受损、肝功能异常、肾功能减退等，进而引发多脏器功能衰竭。病毒感染重症化： 像重症流感病毒感染，可能会引发急性呼吸窘迫综合征，同时影响心脏、肾脏等器官。流感病毒侵犯肺部造成呼吸功能障碍，还会影响心肌功能，导致心输出量减少，肾脏灌注不足，出现肾功能不全，逐步发展为多脏器功能衰竭。
二、创伤相关原因
严重创伤： 严重的多发性创伤，如车祸导致的全身多处骨折、内脏损伤等。大量失血会使各脏器灌注不足，同时创伤本身引发的炎症反应会波及多个器官。比如肝脏破裂出血，不仅肝脏功能受损，失血还会影响肾脏的血液供应，导致肾功能下降，同时创伤引起的炎症因子释放会影响心脏功能，从而引发多脏器功能衰竭。大面积烧伤： 大面积烧伤后，皮肤屏障破坏，创面大量渗出，导致血容量减少，各脏器缺血缺氧。而且烧伤后的炎症反应强烈，会影响肺、心、肾等器官。例如，烧伤面积超过50%的患者，很容易出现急性呼吸窘迫综合征（肺功能受损）、心功能不全以及肾功能衰竭等多脏器功能衰竭情况。
三、休克相关原因
低血容量性休克： 由于大量失血或失液引起，如消化道大出血，短时间内失血量超过人体总血量的20%以上，就会导致心、脑、肾等重要脏器灌注不足。肾脏灌注不足会使尿量减少甚至无尿，心脏灌注不足会出现心率加快、血压下降等心功能不全表现，同时肝脏等器官也会因缺血出现功能异常，进而发展为多脏器功能衰竭。感染性休克： 由严重感染导致，细菌毒素等作用使血管扩张，血管通透性增加，有效循环血量减少。感染性休克会影响多个器官，比如感染性休克时，肺部可能出现弥漫性炎症导致呼吸衰竭，肾脏因缺血缺氧出现急性肾衰竭，肝脏也会因代谢和解毒功能障碍受损，最终引发多脏器功能衰竭。