HPV疫苗打完后可能出现一些不良反应，一般来说，常见的不良反应发生率较低。比如，接种部位可能出现疼痛、红肿、瘙痒等情况，这种情况大概在10% - 30%左右的受种者中会出现，通常1 - 3天可自行缓解。
接种部位的不良反应
局部疼痛： 接种后少数人会感到接种部位有疼痛感，一般程度较轻，不需要特殊处理，多数在短时间内会自行消失。局部红肿： 接种部位可能出现红肿，红肿范围通常比较局限，直径一般不超过5厘米，一般也是在几天内逐渐消退。
全身的不良反应
发热： 部分人接种后可能出现发热，一般为低热，体温在37.1 - 38℃之间较为常见，这种发热情况大约占不良反应的5% - 10%，通常1 - 2天就会退热。乏力： 有些受种者会感觉身体乏力，没有什么精神，一般休息一段时间后就会缓解。
其他可能的不良反应
头痛： 个别人接种后会出现头痛症状，头痛程度有轻有重，多数为轻微头痛，通过适当休息等一般能得到缓解。恶心： 极少数人可能出现恶心的感觉，一般程度不严重，不会影响正常生活，大多也能自行恢复。需要注意的是，这些不良反应大多是轻微且暂时的。如果接种后出现严重不适，比如高热持续不退、接种部位出现严重红肿且范围不断扩大、出现呼吸困难等严重症状，应立即就医。同时，接种疫苗后要在接种现场观察30分钟左右，以便出现严重不良反应时能及时处理。接种者自身也要多留意身体状况，若有异常情况及时与接种机构沟通。