戒烟后咳嗽是身体在进行自我修复的常见现象，一般会持续数周甚至数月。比如，有研究发现约70%戒烟者会出现咳嗽等戒断反应。
身体自我修复机制
当停止吸烟后，呼吸道的纤毛开始恢复功能。纤毛是呼吸道内像毛发一样的结构，正常情况下能清扫呼吸道内的异物、黏液等。戒烟前，吸烟产生的有害物质会损伤纤毛，使其运动变慢或功能失常。戒烟后，纤毛需要约1 - 3个月逐渐恢复正常摆动，在这个过程中，呼吸道会通过增加黏液分泌和咳嗽来清除堆积的废物，从而引发咳嗽。
气道敏感性变化
戒烟后，气道的敏感性会发生改变。原本长期吸烟导致气道处于一种受刺激的高反应状态，停止吸烟后，这种高反应性不会立刻消失。气道变得相对更加敏感，周围环境中的一些微小刺激，像冷空气、灰尘等，都可能更容易引发咳嗽反射。例如，在季节更替时，气温变化明显，戒烟者可能会因吸入冷空气而更容易咳嗽。
肺部清理过程
吸烟会使肺部积累大量焦油、尼古丁等有害物质，戒烟后，肺部的巨噬细胞等免疫细胞会积极参与清理这些堆积物。巨噬细胞会吞噬这些有害物质，在这个过程中可能会刺激呼吸道引发咳嗽。一般这个肺部清理过程会持续数周，咳嗽也会随之存在，直到肺部将大部分堆积的有害物质清除干净。
个体差异影响
每个人戒烟后咳嗽的情况有所不同。年龄较大的戒烟者可能恢复相对慢一些，咳嗽持续时间可能稍长；而身体状况较好、年轻的戒烟者，咳嗽可能相对较轻且持续时间较短。另外，本身有基础呼吸道疾病的人，如慢性支气管炎患者，戒烟后咳嗽往往会更明显且恢复更慢，这类人群可能需要更加关注呼吸道的护理，比如保持室内空气湿润等。