灰指甲的治疗方法有多种，一般可以通过外用药物、口服药物以及手术等方式来改善。外用药物治疗方面，像阿莫罗芬搽剂，每周使用1-2次，坚持使用几个月可能会有效果，但相对来说疗程较长。
外用药物治疗
阿莫罗芬搽剂： 它能干扰真菌细胞膜的合成，从而发挥抗真菌作用。使用时要先清洁病甲，然后均匀涂抹在病甲上，每周使用1 - 2次，一般需要连续使用几个月才能看到明显效果。不过，它对于比较严重的灰指甲效果可能有限。环吡酮胺乳膏： 同样是通过抑制真菌的生长来起作用。可以直接涂抹在病甲及周围皮肤，每天使用1 - 2次，要坚持涂抹，可能需要持续数月。
口服药物治疗
伊曲康唑： 它是一种广谱抗真菌药物，采用冲击疗法，即服用1周停3周为一个疗程，一般需要2 - 3个疗程。它能够抑制真菌细胞的麦角固醇合成，从而达到杀灭真菌的目的。但服用伊曲康唑前需要检查肝功能，因为它可能会对肝脏有一定影响，有肝脏疾病的患者要谨慎使用。特比萘芬： 也是常用的口服抗真菌药，一般每天服用一次，连续服用数周。它可以抑制真菌角鲨烯环氧化酶，阻断真菌细胞膜合成，从而发挥抗真菌作用。同样，服用前也需要关注肝功能情况。
手术治疗
病甲清除术： 对于单个比较严重的灰指甲，可以考虑手术拔除病甲。不过手术拔除病甲后，新长出来的指甲有可能还是会受到真菌感染，而且术后恢复需要一定时间，期间要注意保持伤口清洁，避免感染。一般适用于病情比较局限，外用和口服药物效果不佳的情况。