舌头根下面有个透明的小水泡，可能是以下原因引起：
1.黏液腺囊肿：是由于黏液腺排泄管受阻，腺体内的分泌物潴留而形成的浅表囊肿。好发于下唇及舌尖腹侧。囊肿位于黏膜下，呈半透明状，表面覆盖正常黏膜，有时可出现水肿、溃疡和糜烂。如果囊肿破裂，可排出蛋清样透明黏稠液体，囊肿消失。一般需要进行手术切除。
2.口腔疱疹：是由单纯疱疹病毒感染引起的口腔黏膜疾病。水疱可发生于舌头根下面，呈透明状，周围有红晕，水疱破溃后可形成溃疡。可伴有发热、头痛、咽痛等症状。一般需要进行抗病毒治疗，如口服利巴韦林、阿昔洛韦等。
3.手足口病：是由肠道病毒感染引起的传染病。可在舌头根下面出现水疱，同时可伴有口腔黏膜溃疡、发热、咳嗽、流涕等症状。一般需要进行对症治疗，如退热、止咳、口腔护理等。
4.其他：舌头根下面有个透明的小水泡还可能是其他原因引起，如舌炎、口腔黏膜纤维化等。
如果发现舌头根下面有个透明的小水泡，建议及时就医，明确诊断，并在医生的指导下进行治疗。同时，应注意保持口腔卫生，避免食用辛辣、刺激性食物。