抗乙肝病毒的药物有多种，目前常用的有恩替卡韦和替诺福韦等。一般来说，恩替卡韦是核苷类似物，能抑制乙肝病毒多聚酶，从而抑制病毒复制，通常需要长期服用。而替诺福韦也是核苷酸类似物，对乙肝病毒的抑制作用较强，也需长期用药。不过哪种药最好不能一概而论，要根据患者具体情况来定。
常用抗乙肝病毒药物种类
恩替卡韦：属于鸟嘌呤核苷类似物，它可以通过磷酸化成为具有活性的三磷酸恩替卡韦，三磷酸恩替卡韦与自然底物三磷酸脱氧鸟苷竞争，抑制乙肝病毒多聚酶（逆转录酶）的所有三种活性：（1）HBV多聚酶的启动；（2）前基因组mRNA逆转录负链的合成；（3）HBV DNA正链的合成。替诺福韦：是一种核苷酸类似物，在体内代谢为替诺福韦二磷酸盐，能够抑制乙肝病毒反转录酶和DNA多聚酶，终止病毒DNA链的合成，从而发挥抗病毒作用。
药物适用人群差异
初治患者：对于没有接受过抗病毒治疗的乙肝患者，恩替卡韦和替诺福韦都可以作为选择。一般来说，它们都能较好地抑制病毒复制，改善肝脏炎症等情况。但恩替卡韦在用药48周时，对于乙肝病毒DNA的抑制效果，有大量研究显示能使多数患者的病毒载量明显下降。而替诺福韦对于一些病毒载量较高或者既往使用过其他抗病毒药物效果不佳的患者可能也有较好的效果。特殊人群：对于肾功能不全的患者，替诺福韦需要根据肌酐清除率来调整剂量，而恩替卡韦在肾功能不全时也需要调整给药间隔等。对于孕妇乙肝患者，目前替诺福韦被认为相对更安全，因为恩替卡韦在孕妇中的安全性数据相对有限。
药物耐药情况
恩替卡韦：长期使用恩替卡韦有发生耐药的可能，随着使用时间延长，耐药率会逐渐升高。比如使用5年的耐药率可能会达到一定比例。替诺福韦：替诺福韦发生耐药的情况相对较少，在长期的临床应用中，其耐药率一直维持在较低水平，这也是它的一个优势所在。