血吸虫病的症状因感染阶段不同而有所差异。急性血吸虫病患者在接触疫水后数天至数周内可能出现症状，如发热，热度多在38~40℃之间，可伴有畏寒、寒战等表现，同时可能有腹痛、腹泻、咳嗽等症状。
急性期症状
发热表现： 多数患者体温呈弛张热，体温波动较大，一般持续1~2个月左右。发热时患者还可能伴有全身乏力、盗汗等情况。消化道症状： 较为常见的有腹痛、腹泻，大便多为稀水样便，少数患者可带有黏液甚至脓血。
慢性期症状
消化系统症状： 患者可能出现慢性腹泻、腹痛，大便稀，有时带脓血，长期如此可能导致营养不良、贫血等情况。部分患者会有肝脾肿大的表现，早期以肝肿大为主，尤其是左叶肝肿大较为常见，随着病情进展，脾逐渐肿大。其他症状： 男性患者可能出现性欲减退、阳痿等表现，女性患者可能出现月经不调等情况。
晚期症状
肝硬化表现： 患者会出现门静脉高压，导致腹水、脾功能亢进、食管胃底静脉曲张等。腹水是晚期血吸虫病常见且较突出的表现，患者腹部膨隆，行走困难。脾功能亢进可导致白细胞、红细胞、血小板减少，出现贫血、出血倾向等。食管胃底静脉曲张破裂时，可出现大量呕血和黑便，严重时可危及生命。侏儒症表现： 儿童患者感染严重时，可影响生长发育，导致侏儒症，表现为身材矮小、面容苍老等。