灰趾甲的治疗方法有多种，一般可以通过外用药物、口服药物以及手术等方式来处理。外用药物方面，像阿莫罗芬搽剂就常被使用，它需要坚持使用较长时间，通常每周使用1 - 2次，连续使用数月才有效果。
外用药物治疗：
阿莫罗芬搽剂： 这是一种局部抗真菌药物，它能抑制真菌细胞膜的合成，从而发挥抗真菌作用。使用时要先清洁病甲，然后将搽剂涂抹在病甲上，一般每周使用1 - 2次，不过需要连续使用数月才能看到明显效果。环吡酮胺乳膏： 同样属于外用抗真菌药，它可以改变真菌细胞膜的完整性，影响真菌的代谢过程。使用时均匀涂抹在病甲及周围皮肤，一天使用1 - 2次。
口服药物治疗：
伊曲康唑： 是一种合成的三氮唑类广谱抗真菌药，它可以抑制真菌细胞色素P450酶系统，从而影响真菌细胞膜的合成。服用方法通常是冲击疗法，即吃一周停三周为一个疗程，一般需要进行2 - 3个疗程，不过在用药前需要检查肝功能，因为它可能会对肝脏有一定影响。特比萘芬： 能特异性地抑制真菌角鲨烯环氧化酶，阻断真菌细胞膜合成过程中的角鲨烯环氧化反应，从而发挥抗真菌作用。一般每天口服一次，连续服用数周，同样用药前也需要关注肝功能情况。
手术治疗：
拔甲术： 对于病情较轻的灰趾甲患者可以考虑。就是把患病的指甲拔掉，不过术后要注意伤口护理，防止感染，而且拔甲后还需要配合外用或口服抗真菌药物，一般术后需要定期换药，让新的指甲慢慢生长，这个过程可能需要几个月时间。激光治疗： 利用特定波长的激光照射病甲，破坏真菌的生存环境，起到抑制真菌的作用。激光治疗相对痛苦较小，一般需要多次治疗，每次治疗间隔一定时间，不过具体的治疗次数要根据病情严重程度来定。