三个月宝宝拉绿屎通常是由于大便中含有部分胆汁导致的，其原因主要包括生理性因素、喂养不当以及疾病等，需依据具体情况判断，必要时针对病因予以治疗。
一、生理性因素。三个月宝宝多以奶为主要食物，肠道蠕动相对较快，可能会排出一定量胆汁，进而出现大便绿色情况，且无其他不适症状，此时可暂时先观察。
二、喂养不当。
1.三个月宝宝若奶量摄入不足，易产生过度饥饿，这会加快肠道蠕动，促进排泄，从而可能导致大便绿色，建议加强喂养，以按需哺乳为主，保证奶量摄入，有助于改善该症状。
2.但要注意需少量多餐进行喂养，避免过度喂养。
三、疾病。部分三个月宝宝患有消化不良、急性胃肠炎等疾病时，易引发肠道功能紊乱以及肠道菌群失调，从而出现大便绿色现象，同时会伴有大便次数及性状改变，建议在医师指导下使用对症药物治疗，通常会用到肠道益生菌、肠道黏膜保护剂，如复方嗜酸乳杆菌片、蒙脱石散等。
总之，当三个月宝宝出现拉绿屎时，要仔细分析原因，必要时采取相应的措施进行干预和治疗。