霉菌性阴炎主要是由白色念珠菌等真菌感染引起，约75%的女性一生中至少患过1次霉菌性阴炎。
阴道内环境失衡
阴道正常菌群变化： 阴道内原本存在多种微生物，正常情况下乳酸杆菌占优势，维持酸性环境（pH值通常在3.8~4.4），抑制念珠菌过度生长。当长期使用抗生素时，会抑制乳酸杆菌生长，破坏阴道菌群平衡，念珠菌就可能大量繁殖引发炎症。比如，连续使用广谱抗生素超过1周，霉菌性阴炎的发病风险会明显增加。局部pH改变： 怀孕时，女性体内雌激素水平升高，会使阴道上皮细胞内糖原含量增加，阴道pH值改变，有利于念珠菌生长繁殖。另外，糖尿病患者血糖控制不佳时，阴道内糖原含量高，同样易导致念珠菌感染引发霉菌性阴炎。
外部感染途径
接触感染物品： 使用公共浴池、浴盆、马桶、毛巾等间接接触被念珠菌污染的物品，就有可能感染霉菌性阴炎。例如，公共马桶圈上如果有残留的念珠菌，健康人接触后就可能被传染。据统计，公共浴室的毛巾等物品上念珠菌的携带率较高。性传播： 霉菌性阴炎也可通过性接触传播，女性的性伴侣可能成为带菌者，与携带念珠菌的伴侣发生无保护性行为，女性被感染的几率会升高。
机体免疫力下降
长期使用免疫抑制剂： 像患有自身免疫性疾病需要长期服用糖皮质激素等免疫抑制剂的患者，机体免疫力降低，容易受到念珠菌侵袭引发霉菌性阴炎。比如，患有系统性红斑狼疮长期服用泼尼松的患者，霉菌性阴炎的发病风险比正常人高很多。患有其他基础疾病： 艾滋病患者由于免疫系统严重受损，更容易反复发生霉菌性阴炎，而且病情往往比较顽固。此外，长期营养不良、过度劳累等也会导致机体免疫力下降，增加霉菌性阴炎的发病几率。