擦腿综合症的原因目前尚未完全明确，可能与多种因素有关。一般认为，局部刺激是常见原因之一，比如外阴局部有炎症、湿疹、蛲虫感染等情况时，会引起局部瘙痒，从而导致孩子通过擦腿等动作来缓解不适；神经系统发育不完善也可能是一个因素，婴幼儿时期神经系统发育还不成熟，对肌肉的控制能力有限，可能会出现不自主的擦腿动作；还有心理因素，当孩子精神紧张、焦虑、缺乏关爱等时，也可能通过擦腿来寻求心理上的安慰。
局部刺激因素
皮肤炎症影响： 如果孩子外阴部位存在湿疹，局部皮肤会有瘙痒、发红等症状，孩子就可能通过摩擦腿部等方式来缓解局部的不适。比如有些孩子外阴湿疹较为明显时，就容易出现擦腿的情况。蛲虫感染干扰： 当孩子肠道内有蛲虫寄生时，蛲虫会在夜间爬出肛门，刺激外阴皮肤，引起瘙痒，这也会促使孩子出现擦腿综合症的表现。例如有研究发现，部分患有擦腿综合症的儿童可能同时存在蛲虫感染的情况。
神经系统发育因素
婴幼儿阶段特点： 婴幼儿时期，孩子的神经系统还处于不断发育完善的过程中。在这个阶段，神经对肌肉的控制能力相对较弱，可能会出现一些不自主的运动行为，擦腿综合症就是其中一种表现。一般来说，随着孩子年龄增长，神经系统逐渐发育成熟，这种情况可能会有所改善，但如果持续存在且较为明显，就需要关注。神经调节不稳定： 由于婴幼儿神经调节功能不够稳定，容易出现兴奋和抑制过程的不平衡，当受到一些轻微刺激时，就可能引发不自主的擦腿动作。比如周围环境稍有变化，孩子可能就会通过擦腿来做出反应。
心理因素影响
精神紧张状态： 当孩子处于精神紧张的状态时，比如在陌生环境中、面临较大的学习压力（虽然幼儿阶段学习压力相对较小，但也可能因家庭氛围等原因产生紧张感），就可能通过擦腿来缓解内心的紧张情绪。例如有些孩子换了新的幼儿园，适应过程中可能会出现擦腿综合症的表现。缺乏关爱情况： 如果孩子在日常生活中缺乏足够的关爱和陪伴，心理上感到孤独、不安，也可能通过擦腿来寻求心理上的慰藉。比如父母工作繁忙，很少有时间陪伴孩子，孩子可能就会通过这种方式来获得一定的心理满足。