小孩拉肚子发烧时，可根据具体情况选择药物。一般来说，可使用益生菌调节肠道菌群，如枯草杆菌二联活菌颗粒等，能在一定程度上缓解拉肚子的情况，通常这类药物相对安全。
退烧药的选择
对乙酰氨基酚：适用于3个月以上的小孩，它通过抑制前列腺素合成发挥解热镇痛作用，能有效降低体温，一般服用后0.5 - 1小时左右开始起效。布洛芬：适合6个月以上的小孩，同样是通过抑制前列腺素合成来退热，退热持续时间相对较长，约6 - 8小时。但要注意，小孩使用退烧药需严格按照体重或年龄来选择合适的剂量，不能自行随意用药。
止泻药的选择
蒙脱石散：它可以吸附肠道内的病菌和毒素，保护肠道黏膜，对小孩拉肚子有一定的缓解作用。服用时要注意用适量温水冲服，且最好在饭前1小时服用。双歧杆菌四联活菌片：属于益生菌类药物，能调节肠道菌群平衡，改善肠道功能，从而缓解拉肚子的症状，一般需要用温水送服，且温度不宜过高，以免影响药效。
病因相关药物
病毒感染：如果是病毒感染引起的拉肚子发烧，一般没有特定的抗病毒药物直接治疗，主要是对症处理。比如拉肚子严重就用蒙脱石散等止泻，发烧就用退烧药。细菌感染：若考虑是细菌感染导致，可能会用到抗生素，如头孢克肟等，但使用抗生素必须在医生明确诊断后，严格遵医嘱使用，因为小孩使用抗生素需要谨慎，要根据感染的细菌种类和小孩的具体情况来选择合适的抗生素。同时，不管是哪种原因引起的小孩拉肚子发烧，都要注意给小孩适当补充水分，防止脱水，可以让小孩多喝一些口服补液盐。