女性急性尿道炎主要是由细菌等病原体感染引起的，比如大肠埃希菌等常见细菌，大约有80%的急性尿道炎是由这类细菌导致的。
病原体感染途径
上行感染： 这是最常见的途径，细菌由尿道外口进入尿道，然后沿着尿道上行感染膀胱、输尿管甚至肾脏。比如女性尿道较短且宽，尿道口又靠近肛门，大便中的细菌很容易污染尿道，从而引发感染。像有研究显示，约50%的女性在性生活后容易发生急性尿道炎，就是因为性生活可能会将外阴或阴道内的细菌挤入尿道。血行感染： 细菌从身体其他部位的感染病灶，通过血液循环到达尿道引发炎症。这种情况相对较少见，但也可能发生，比如患有皮肤感染、呼吸道感染等疾病时，细菌可通过血液传播到尿道。
局部因素影响
尿道局部损伤： 女性如果有尿道器械检查，比如导尿等操作，可能会损伤尿道黏膜，使细菌更容易侵入引发感染。另外，性生活时过于剧烈等也可能造成尿道局部损伤，增加感染风险。尿道梗阻： 比如尿道结石、尿道狭窄等情况，会导致尿液排出不畅，尿液在尿道内停留时间过长，细菌容易滋生繁殖，从而引发急性尿道炎。据统计，大约10% - 15%的尿道梗阻患者会并发急性尿道炎。
机体抵抗力下降
自身免疫力低： 当女性身体抵抗力下降时，比如长期劳累、患有慢性疾病（如糖尿病等）、长期服用免疫抑制剂等，身体对细菌的抵御能力减弱，就容易受到细菌侵袭而引发急性尿道炎。例如，糖尿病患者由于血糖控制不佳，尿液中含糖量高，有利于细菌生长繁殖，所以糖尿病女性患者发生急性尿道炎的几率比正常人高很多。经期卫生不佳： 女性在月经期间，身体抵抗力相对较低，而且经血是细菌良好的培养基，如果不注意经期卫生，如不及时更换卫生巾等，很容易导致细菌滋生感染尿道，引发急性尿道炎。一般来说，经期女性急性尿道炎的发生率比非经期要高约2 - 3倍。