HPV感染后多数人没有明显症状，部分人可能出现生殖器部位的异常表现。比如，女性感染高危型HPV，长时间持续感染可能引发宫颈病变，但早期也可能无症状。而低危型HPV感染可能会在生殖器部位长出疣体，像尖锐湿疣，表现为外阴、阴道、宫颈等部位出现单个或多个淡红色小丘疹，逐渐增多、增大，形态多样，可呈乳头状、菜花状、鸡冠状等。
皮肤低危型HPV感染症状
寻常疣：多发生在手部等皮肤部位，表现为表面粗糙的丘疹，质地较硬，大小不一，一般没有自觉症状，偶尔可能会有压痛。跖疣：发生在足底，是黄豆大小的角质性丘疹，表面粗糙，边界清楚，周围有增厚的角质环，走路时可能会有疼痛。
皮肤高危型HPV感染症状
鲍温样丘疹病：好发于外阴、肛周等部位，表现为多个扁平的丘疹，颜色为棕红色、褐色或黑色，一般无自觉症状。
黏膜低危型HPV感染症状
生殖器疣（尖锐湿疣）：主要通过性接触传播，除了生殖器部位，也可能出现在肛门周围。初期为细小淡红色丘疹，后逐渐增大增多，融合成乳头状、菜花状或鸡冠状赘生物，表面凹凸不平，湿润柔软，易出血。
黏膜高危型HPV感染症状
宫颈病变相关症状：高危型HPV持续感染宫颈，可能引起宫颈上皮内瘤变，早期通常没有明显症状，随着病情发展，可能出现阴道不规则出血，比如性交后出血、绝经后阴道出血等，还可能有阴道分泌物增多的情况。