咽炎的治疗药物有多种，常见的有含漱液类药物，比如复方硼砂含漱液，可用于清洁口腔、杀菌消炎，一般每天含漱数次。
局部治疗药物
含片类： 如碘喉片，能缓慢释放出碘，有杀菌、抑菌、消肿、止痛等作用；还有西瓜霜含片，具有清热解毒、消肿止痛的功效，可缓解咽炎引起的咽部疼痛、咽干等症状。喷雾剂类： 例如口腔炎喷雾剂，能清热解毒、消炎止痛，用于治疗咽炎时可直接喷于咽部，减轻炎症反应。
全身治疗药物
抗生素类： 如果是细菌感染引起的咽炎，可使用抗生素。比如青霉素类的阿莫西林，对多种细菌有抑制作用，但对青霉素过敏者禁用；头孢菌素类的头孢拉定，也是常用的抗生素，使用前需确认患者是否有头孢类药物过敏史。抗病毒类： 若是病毒感染导致的咽炎，可使用抗病毒药物，如利巴韦林，不过要注意其可能存在的不良反应。
中药类药物
中成药： 像蓝芩口服液，有清热解毒、利咽消肿的作用，可用于急性咽炎属肺胃实热证者；还有蒲地蓝消炎口服液，能清热解毒、抗炎消肿，对咽炎有一定的治疗效果。中药类药物相对副作用可能相对较小，但也需按照药品说明书或医嘱使用。咽炎患者在使用药物时，要根据自身病情在医生指导下合理选择。同时，除了药物治疗，还应注意清淡饮食，多喝水，避免过度用嗓等，这样有助于咽炎的康复。