脂溢性角化症的治疗方法有多种。一般来说，对于较小且无症状的脂溢性角化症可以先观察，而对于影响外观或有不适的情况可采取相应治疗。
冷冻治疗
原理： 通过低温使病变组织坏死脱落。冷冻治疗时，医生会用液氮等低温物质接触皮损部位，让病变细胞受冻破坏。注意事项： 治疗后局部可能会出现水疱、结痂，要保持局部清洁干燥，避免感染。一般1 - 2周结痂会脱落，可能需要多次治疗才能完全去除。
激光治疗
原理： 利用激光的能量击碎病变组织。常用的有二氧化碳激光等，激光能精准作用于脂溢性角化症的皮损处，将病变细胞气化掉。注意事项： 治疗后局部会有轻微红肿，短时间内要避免沾水。一般1周左右红肿消退，皮肤逐渐恢复，但也可能需要根据皮损情况进行多次激光治疗。
手术治疗
适用情况： 对于较大、怀疑有恶变可能的脂溢性角化症可考虑手术切除。手术切除是直接将病变组织完整切除，然后进行缝合。注意事项： 手术需要在无菌环境下进行，术后要注意伤口护理，按时换药，一般7 - 10天拆线。手术切除后要送病理检查，以明确病变性质。
化学剥脱治疗
原理： 使用化学药剂使病变皮肤剥脱。常用的化学剥脱剂有三氯醋酸等，化学药剂能促使表皮层脱落，从而去除脂溢性角化症。注意事项： 治疗后皮肤会有一定程度的剥脱，要避免日晒，防止色素沉着。在皮肤恢复期间要使用温和的护肤品，一般需要数周时间皮肤才能完全恢复正常状态。