女性尿道口长息肉的原因较多，一般认为可能与慢性炎症刺激、雌激素水平变化等有关。比如长期的尿道炎等慢性炎症反复刺激尿道口黏膜，可能导致组织增生形成息肉；绝经后女性雌激素水平下降，局部黏膜抵抗力减弱，也容易出现尿道口息肉。
慢性炎症刺激相关
局部长期炎症：像尿道炎，如果没有得到及时有效的治疗，炎症持续存在，会不断刺激尿道口的黏膜组织，使得黏膜细胞异常增生，从而增加尿道口长息肉的风险。一般来说，尿道炎如果急性期没有彻底治愈，迁延不愈超过3个月就可能算慢性炎症了。卫生习惯不佳：不注意外阴局部清洁，细菌等病原体容易滋生，长期刺激尿道口，也容易引发炎症进而导致息肉形成。比如有的女性每天清洗外阴的次数过少，或者使用不恰当的洗液等，都可能影响外阴局部环境，增加炎症发生概率。
雌激素水平变化方面
绝经后女性：绝经后女性体内雌激素水平明显降低，尿道口黏膜会变得薄且脆弱，局部抵抗力下降，容易受到各种因素影响而出现组织增生，形成息肉。据统计，50岁以上绝经后的女性，尿道口息肉的发生率相对较高。孕期激素影响：孕期女性体内雌激素水平也会升高，不过部分女性在孕期可能因为局部组织对激素变化比较敏感，也可能出现尿道口黏膜增生情况，但相对绝经后女性来说，孕期这种情况相对少见一些，但也有发生可能。
其他可能因素
局部损伤：比如性生活时过于剧烈等情况导致尿道口局部损伤，在修复过程中如果出现异常增生，也可能形成息肉。另外，一些医源性操作，如导尿等，如果操作不当造成尿道口损伤，也可能增加长息肉的几率。遗传因素：虽然遗传因素导致女性尿道口长息肉的情况相对较少见，但也有研究发现部分人群可能存在一定的遗传易感性，使得他们在相同的外界因素刺激下更容易出现尿道口黏膜增生形成息肉。不过目前关于遗传因素在其中的具体作用机制还在进一步研究中。