胎儿亲子鉴定的费用一般在2000~5000元一次。不过，具体价格会因地区、检测机构以及检测方法的不同而有所差异。
检测机构差异
正规司法鉴定机构： 这类机构的胎儿亲子鉴定费用相对较为规范，一般在3000元左右，但也可能因地区经济水平等因素有所波动。比如在一些一线城市的正规司法鉴定机构，可能会接近5000元。非正规机构： 有些不正规的机构收费可能会偏低，但是其检测的准确性和安全性难以保障，不建议选择。
检测方法不同
羊水穿刺亲子鉴定： 这种方法的费用大概在2000~3000元一次。它是通过抽取孕妇羊水来获取胎儿细胞进行鉴定，不过该方法有一定的风险，可能会导致孕妇流产等情况，一般适用于怀孕16~22周的孕妇。绒毛穿刺亲子鉴定： 费用通常在2500~4000元一次。是在怀孕11~14周时，抽取绒毛组织进行鉴定，同样存在一定的流产风险。
样本采集方式影响
自行采集样本： 如果自己采集样本再送去检测，可能会因为样本不合格等情况需要重新采集，而且费用和在机构采集差不多。但自己采集样本容易出现样本污染等问题，影响鉴定结果的准确性。机构上门采集样本： 机构上门采集样本会收取一定的上门服务费用，大概在200~500元左右，所以总费用会比在机构内采集稍高一些。