小儿感冒反复发烧多是因为感染未彻底控制、自身免疫力较弱等原因。一般来说，儿童感冒后若病原体未被完全清除，就容易反复发烧，比如病毒感染时，可能需要3~5天甚至更长时间才能让体温稳定。
感染因素未控制
病毒未清除彻底：
儿童感冒多数由病毒引起，像常见的鼻病毒、流感病毒等。如果病毒在体内没有被完全消灭，就会不断刺激机体免疫系统，导致反复发烧。比如流感病毒感染，病程可能相对较长，即使经过初期治疗，体内仍可能残留少量病毒，从而引发反复发热。
细菌继发感染：
感冒后儿童身体抵抗力下降，容易继发细菌感染。例如原本是病毒感冒，之后合并了链球菌感染，此时单纯针对感冒的治疗可能无法控制发烧，会出现反复发烧的情况，而且可能还会伴有咳嗽加重、咳痰等症状。
自身免疫力因素
幼儿自身免疫不完善：
婴幼儿的免疫系统还处于发育阶段，相对较弱。当受到感冒病毒或细菌侵袭时，免疫反应的调节能力不如成人，很难迅速有效地将病原体清除，所以容易出现反复发烧的状况。一般6个月 - 5岁的儿童由于免疫系统尚未完全成熟，感冒后反复发烧的概率相对更高。
营养状况影响：
如果小儿存在营养不良的情况，比如蛋白质、维生素等摄入不足，会影响免疫系统的正常功能，使身体对抗感染的能力下降，进而导致感冒后反复发烧。像缺乏维生素C时，机体的免疫力会降低，更易受到病原体侵扰，引发反复发热。
体温调节机制不完善
小儿的体温调节中枢发育还不够成熟，对体温的调节能力较差。当感染等因素导致体温升高后，体温调节中枢不能很好地协调散热和产热过程，容易出现体温波动，表现为反复发烧。尤其是在外界环境温度变化时，这种体温调节的不稳定性会更加明显，比如在室内外温差较大的情况下，小儿感冒后更易反复发烧。