怀孕HPV阳性的处理方式如下：
一、治疗方式：
1.物理治疗：包括激光、冷冻、电灼治疗等。
2.药物治疗：可选择使用干扰素等药物。
3.若病情严重，分娩前可进行剖宫产手术，避免母婴传播感染胎儿。
二、后续检查：结合宫颈液基细胞学、阴道镜等检查结果决定治疗方法，若检查无异常，可分娩后再治疗。
三、HPV相关说明：
1.HPV即人乳头瘤病毒，危险程度高，分低危型和高危型两类。
(1)低危型可引起各种传染性疾病。
(2)高危型可导致宫颈癌等恶性肿瘤。
四、孕期注意事项：
1.不能随意用药，应遵医嘱积极配合治疗，按时复查，不可私自用药以免致胎儿畸形影响发育。
2.做好外阴护理工作，勤换内裤，内裤可用开水煮烫并在阳光下暴晒。
3.注意饮食调理，以高蛋白质为主，多吃新鲜瓜果、蔬菜。
4.多休息，避免过度劳累。
总之，怀孕时查出HPV阳性，要根据具体情况选择合适的治疗方式，同时注意孕期的各项事项，以保障自身和胎儿的健康。