阴茎上长小水泡可能是生殖器疱疹、包皮龟头炎、过敏、尖锐湿疣等原因引起的。
1.生殖器疱疹：由单纯疱疹病毒感染引起，主要通过性接触传播。表现为阴茎、龟头或冠状沟处长出多个小水泡，破溃后形成糜烂或溃疡，伴有疼痛、瘙痒等症状。生殖器疱疹具有传染性，治疗主要采用抗病毒药物，如阿昔洛韦、伐昔洛韦等。同时，注意保持局部清洁，避免搔抓，防止感染扩散。性伴侣也应同时接受检查和治疗，治疗期间应避免性生活。
2.包皮龟头炎：可由细菌、真菌感染或局部刺激引起。表现为阴茎头和包皮内板红肿、疼痛，可有小水泡或糜烂，伴有脓性分泌物。治疗方法因病因而异，如细菌感染引起的可用抗生素治疗，真菌感染引起的可用抗真菌药物治疗，同时注意局部清洁。反复发作的包皮龟头炎可能需要行包皮环切术。
3.过敏：对避孕套、精液、某些药物或清洁剂等过敏，也可能导致阴茎上长小水泡。表现为局部红肿、瘙痒，水泡破溃后可有渗出。治疗主要是避免接触过敏原，同时使用抗过敏药物，如氯雷他定、西替利嗪等。
4.尖锐湿疣：由人乳头瘤病毒感染引起，主要通过性接触传播。表现为阴茎、龟头或冠状沟处长出菜花状或乳头状赘生物，质软，表面湿润，可有恶臭。治疗方法包括物理治疗、药物治疗和免疫疗法。物理治疗如激光、冷冻、电灼等，药物治疗常用的有咪喹莫特乳膏、鬼臼毒素酊等，免疫疗法如干扰素等。尖锐湿疣易复发，治疗后需定期复查。
需要注意的是，以上只是一些常见的原因，阴茎上长小水泡还可能是其他疾病引起的。如果出现这种情况，建议及时就医，明确诊断后进行相应的治疗。同时，注意个人卫生，保持局部清洁干燥，避免搔抓，避免不洁性生活。