宝宝脚趾甲分层断裂，主要原因可能包括以下几方面：
一、鞋子不合脚：宝宝处于生长发育期，脚长得快，如果所穿鞋子太小，长期挤压脚趾甲，会对其造成不良刺激，从而导致脚趾甲分层断裂，需及时依据宝宝生长情况更换合适鞋码。
二、外力刺激：
1.趾甲形状：可能与留的趾甲形状有关，如给宝宝剪趾甲时留得较长，因长期外力作用，会使宝宝脚趾甲逐渐断裂分层，应根据宝宝指甲生长情况适当剪趾甲，避免趾甲过长。
三、趾甲营养不良：
1.营养缺乏：若宝宝长期食欲不佳，有偏食、挑食情况，导致明显微量元素缺乏，尤其是缺锌、钙、维生素A等，可能引起趾甲分层断裂或凹陷等症状。可遵医嘱在甲周外涂尿素霜，或口服维生素AD滴剂、维生素E软胶囊等以营养指甲。
四、真菌感染：
1.感染原因：若宝宝出现脚癣即真菌感染，真菌持续刺激可致脚趾甲分层断裂，因真菌感染具传染性，可能是家人患有甲癣或脚气、趾癣而使宝宝脚趾出现真菌感染。可在医生指导下应用抗真菌药物进行治疗，如涂抹复方酮康唑乳膏、盐酸萘替芬乳膏等。
总之，当发现宝宝脚趾甲出现分层断裂时，要综合考虑多种可能因素，及时采取相应措施进行改善和治疗。