急性或初发的肛裂可用坐浴和润便的方法治疗，慢性肛裂可用坐浴、润便加扩肛的方法，经久不愈、保守治疗无效且症状较重者可采用手术治疗。
一、非手术治疗
1.排便后用1:5000高锰酸钾温水坐浴，以保持局部清洁。
2.口服缓泻剂或石蜡油，让大便松软、润滑，同时增加饮水和多纤维食物来纠正便秘，保持大便通畅。
3.使用血管扩张剂，如0.2%的硝酸甘油软膏、硝普纳、血管紧张素转化酶抑制剂、钙通道阻滞剂等，其可作用于平滑肌，使肛门内括约肌松弛，肛管压力下降，改善肛裂部位血液循环，促进愈合。
二、手术疗法
1.肛裂切除术，即切除全部增殖的裂缘、前哨痔、肥大的肛乳头、发炎的隐窝和深部不健康的组织，直至暴露肛管括约肌，可同时切断部分外括约肌皮下部或内括约肌，创面敞开引流，但缺点是愈合较慢。
2.肛管内括约肌切断术，手术方法是在肛管一侧距肛缘1-1.5cm作小切口达内括约肌下缘，确定括约肌间沟后分离内括约肌至齿状线，剪断内括约肌，然后扩张至4指，电灼或压迫止血后缝合切口，可一并切除肥大乳头、前哨痔，肛裂在数周后会自行愈合，不过该方法若手术不当可导致肛门失禁。
总之，肛裂的治疗方法需根据具体情况选择，非手术治疗主要是缓解症状和促进愈合，手术治疗则针对较为严重且保守治疗无效的情况，但要注意手术风险。