肛门肌肉一收缩就疼且有绿色分泌物，可能与以下几种原因有关。
1.肛裂：肛管皮肤全层纵行裂开并形成感染性溃疡，多由便秘引起。典型表现为肛门疼痛、便血和便秘。肛门括约肌痉挛收缩时会引起疼痛，裂口继发感染时会有绿色分泌物。
2.肛周脓肿：肛管、直肠周围软组织内或其周围间隙内发生急性化脓性感染，并形成脓肿，多由肛腺感染引起。常见症状为肛周持续性跳动性疼痛，全身感染症状不明显。当脓肿破溃后，疼痛可暂时缓解，有绿色分泌物排出。
3.肛管炎：肛管部位发生的急慢性炎症，多由肛窦炎、肛乳头炎等感染引起。主要症状为肛门部下坠感、疼痛，肛管黏膜水肿、充血，并有脓性分泌物。
4.其他：肠道炎症、肛管或直肠损伤、肛瘘等也可能出现类似症状。
此外，一些全身性疾病，如克隆病、溃疡性结肠炎等，也可能导致肛门疼痛和分泌物异常。
由于可能的原因较多，且部分情况可能较为严重，建议及时就医，进行详细的检查，如肛门指诊、肛门镜检查、血常规等，以明确诊断，并采取相应的治疗措施。
在就医前，应注意保持肛门局部清洁，避免搔抓、摩擦，同时应注意饮食清淡，避免食用辛辣、刺激性食物。