怀孕40几天时下面流褐色东西可能有以下几种情况：
一、妇科炎症：怀孕期间若不注重卫生，易引发妇科感染，像阴道炎、宫颈炎、子宫内膜炎等。这可能导致出现褐色分泌物，同时伴有外阴异味及瘙痒。具体如下：
1.阴道炎：可做白带常规检查以明确。若为阴道炎，可在医生指导下使用甲硝唑栓等药物进行治疗。
2.宫颈炎：明确后可遵医嘱用克霉唑栓等药物。
3.子宫内膜炎：确诊后可使用头孢拉定等抗生素进行治疗。
二、先兆流产：怀孕40几天时胚胎发育尚不稳定，此阶段若有同房或剧烈运动等情况，可能引发先兆流产，表现为阴道流出褐色分泌物，并伴有腹部疼痛。建议做B超检查以及抽血检测血液中HCG浓度。确定为先兆流产后，可在医生指导下服用黄体酮和维生素E进行保胎。
三、异位妊娠：若存在异位妊娠，随着胚胎生长发育，可能引起异位妊娠部位破裂，从而导致阴道出现褐色分泌物。可进行B超检查、宫腔镜检查等以确定。必要时需遵医嘱服用米非司酮片、甲氨蝶呤等药物治疗，也可考虑进行宫腔镜手术治疗。
总之，怀孕早期出现下面流褐色东西的情况，应及时就医检查，明确原因，并在医生的指导下进行相应的治疗。