胃镜和肠镜所带来的痛苦不同，没有可比性，具体痛苦感受如下：
一、做胃镜时：在胃镜通过咽喉部时，会刺激咽反射，从而引发恶心、欲呕等症状。并且胃镜在胃内移动过程中可能刺激胃黏膜，也易导致患者出现恶心、呕吐等痛苦表现。
二、做肠镜时：在肠镜经过乙状结肠、脾曲、肝曲等位置时，如果医生反复牵拉肠镜而刺激这些位置，就可能出现腹痛情况。所以胃镜给人的主要感觉是恶心、呕吐，而肠镜主要是腹痛，这两种感觉完全不同，确实不好判断哪个更痛苦。患者在进行胃镜和肠镜检查时若想减轻痛苦，一般建议尽可能让自己放松，并听从医生嘱咐好好配合。
总结：胃镜和肠镜的痛苦表现不同，分别为恶心呕吐和腹痛，患者检查时放松配合有助于减轻痛苦。