怀孕50天有胎芽但未见胎心，可能是以下原因导致：
1.正常现象：胎芽通常在怀孕6-7周时出现，胎心在7-8周时出现。如果月经周期不规律，受精卵着床时间较晚，可能会导致胎芽出现时间早于胎心。建议等待1-2周后复查B超，以明确诊断。
2.胚胎发育不良：如果孕囊平均直径大于25mm时仍未见胎心，或胎芽长度大于7-8mm时未见胎心，提示胚胎发育不良的可能性较大。此时需要结合血HCG和孕酮水平进一步判断。如果HCG翻倍良好，孕酮水平正常，可以继续观察；如果HCG翻倍不好或孕酮水平低，提示胚胎发育不良的可能性较大，需要及时清宫。
3.胎停育：如果孕囊形态不规则，张力欠佳，或卵黄囊过大，提示胎停育的可能性较大。此时需要及时清宫，以免发生稽留流产，导致凝血功能障碍。
4.异位妊娠：如果B超检查发现孕囊位于子宫腔以外，如输卵管、卵巢、宫颈等部位，提示异位妊娠。此时需要及时住院治疗，根据病情选择药物保守治疗或手术治疗。
5.其他：孕妇患有严重的全身性疾病、接触有毒有害物质、夫妻双方染色体异常等，也可能导致胚胎发育不良。
需要注意的是，以上情况需要结合具体情况进行分析。如果在怀孕50天时发现有胎芽但未见胎心，建议及时咨询医生，医生会根据个人情况进行评估，并给出相应的建议。同时，孕妇需要注意休息，避免劳累和剧烈运动，保持良好的心态，有助于胚胎的发育。