支原体和衣原体是两类不同的微生物。支原体是一类没有细胞壁的原核微生物，大小一般在0.3~0.5微米之间，可在人工培养基上生长繁殖；衣原体是一类严格细胞内寄生的原核微生物，直径约0.2~0.3微米。
形态结构特点
支原体形态：支原体形态多样，有球形、杆形、丝状等。它没有细胞壁，所以细胞柔软，形态易变。衣原体形态：衣原体有独特的发育周期，存在原体和始体两种形态。原体较小，呈球形，有感染性；始体较大，呈圆形或椭圆形，代谢活跃，以二分裂方式繁殖。
致病特点
支原体致病：肺炎支原体可引起人类支原体肺炎，主要通过飞沫传播，潜伏期约2~3周，起病较缓慢，主要症状有咳嗽（多为刺激性干咳）、发热等。人型支原体、解脲脲原体等可引起泌尿生殖道感染，如非淋菌性尿道炎等。衣原体致病：沙眼衣原体可导致沙眼，这是世界上致盲的主要原因之一；还可引起包涵体结膜炎、泌尿生殖道感染（如非淋菌性尿道炎等）以及性病淋巴肉芽肿等。肺炎衣原体可引起肺炎、支气管炎等呼吸道疾病。
检测方法
支原体检测：可以通过支原体培养、核酸检测等方法。支原体培养需要特殊的培养基，将标本接种后培养，根据菌落特征等进行鉴定，培养时间一般需要2~3天。核酸检测则是通过检测支原体的核酸来判断是否感染，具有灵敏度高、特异性强的特点。衣原体检测：有直接涂片镜检、细胞培养、核酸检测、血清学检测等方法。直接涂片镜检是取病变部位的分泌物涂片，染色后镜检找衣原体包涵体；细胞培养是将标本接种在敏感细胞上培养，观察细胞病变等；核酸检测同样是检测衣原体的核酸来诊断感染。